Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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PTCH1Q13635 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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PTCH1Q13635 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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PTCH1Q13635 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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