Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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CHAF1BQ13112 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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