Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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PTPRMP28827 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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PTPRMP28827 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRMP28827 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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