Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRAPPC9Q96Q05 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms