Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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COL4A6Q14031 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL4A6Q14031 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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