Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPN13Q12923 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPN13Q12923 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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