Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SH3BP2P78314 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms