Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CENPFP49454 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CENPFP49454 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms