Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PSMB5P28074 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms