Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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RFXAPO00287 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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