Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V9GYQ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V9GYQ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
V9GYQ6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V9GYQ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms