Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
U3KQE9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U3KQE9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U3KQE9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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