Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A3GALT2U3KPV4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms