Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms