Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG4BQ9Y4P1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms