Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOP58Q9Y2X3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOP58Q9Y2X3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms