Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD4AQ9UPU9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms