Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INO80Q9ULG1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INO80Q9ULG1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms