Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms