Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms