Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCF2Q9UG63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCF2Q9UG63 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms