Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN8Q9UBY8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms