Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLKQ9UBT6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms