Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
REREQ9P2R6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
REREQ9P2R6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms