Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRBP1Q9P2E9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms