Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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