Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMOD2Q9NZR1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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