Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD3Q9NYL9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD3Q9NYL9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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