Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLCO1C1Q9NYB5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms