Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CWC25Q9NXE8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms