Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM28Q9NW13 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms