Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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TDP1Q9NUW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDP1Q9NUW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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