Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB4Q9NTQ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms