Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PKDREJQ9NTG1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms