Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPMQ9NSP4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms