Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A13Q9NSD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms