Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRT84Q9NSB2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms