Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNNM1Q9NRU3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms