Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 202.9
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 202.9
UTP3Q9NQZ2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.585e-10■■■■■ 202.9
UTP3Q9NQZ2 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 513.69□□□□□ -0.225e-10■■■■■ 202.9
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 224■■□□□ 1.437e-8■■■■■ 202.7
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.177e-8■■■■■ 202.7
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 202.7
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 59.58□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 202.7
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.547e-8■■■■■ 202.7
UTP3Q9NQZ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.342e-6■■■■■ 202.3
UTP3Q9NQZ2 LMNTD2-203ENST00000469990 1232 ntTSL 1 (best)28.62■■■□□ 2.172e-6■■■■■ 202.3
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 202.3
UTP3Q9NQZ2 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 202.3
UTP3Q9NQZ2 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 56.61□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 202.2
UTP3Q9NQZ2 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 202
UTP3Q9NQZ2 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 202
UTP3Q9NQZ2 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 202
UTP3Q9NQZ2 LPAR2-204ENST00000588233 558 ntTSL 323.64■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 201.9
UTP3Q9NQZ2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 201.9
UTP3Q9NQZ2 LPAR2-206ENST00000589311 355 ntTSL 419.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 201.9
UTP3Q9NQZ2 LPAR2-205ENST00000588461 609 ntTSL 418.26■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 201.9
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 201.9
UTP3Q9NQZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.628e-19■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.378e-19■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 ARAP1-221ENST00000546293 702 ntTSL 318.89■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-207ENST00000458248 742 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-205ENST00000444967 1045 ntTSL 316.2■□□□□ 0.182e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-204ENST00000443285 792 ntTSL 415.68■□□□□ 0.12e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-206ENST00000451553 724 ntTSL 312.36□□□□□ -0.432e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-210ENST00000478006 746 ntTSL 311.73□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.888e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-204ENST00000467667 865 ntTSL 38.81□□□□□ -18e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.048e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-223ENST00000497579 878 ntTSL 38.31□□□□□ -1.088e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.128e-9■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 FAM102B-203ENST00000483371 8333 ntTSL 23.04□□□□□ -1.928e-19■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 201.8
UTP3Q9NQZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.027e-7■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 225.93■■□□□ 1.747e-7■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.157e-7■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 522.19■■□□□ 1.147e-7■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.61e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 201.7
UTP3Q9NQZ2 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 201.6
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.844e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-205ENST00000473751 848 ntTSL 317■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-206ENST00000495203 3168 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-204ENST00000439862 1137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-202ENST00000415329 811 ntTSL 311.04□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 PROCA1-209ENST00000581289 766 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-206ENST00000638317 450 ntTSL 317.64■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-217ENST00000639182 857 ntTSL 514.62□□□□□ -0.074e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-214ENST00000638917 2306 ntTSL 513.72□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-221ENST00000640081 2385 ntTSL 513.34□□□□□ -0.274e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-207ENST00000638347 1651 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-226ENST00000640790 1249 ntTSL 512.45□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-205ENST00000638184 1330 ntTSL 512.14□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-215ENST00000638984 1330 ntTSL 59.81□□□□□ -0.844e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-216ENST00000639097 906 ntTSL 57.37□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 ELP4-213ENST00000638828 4647 ntTSL 24.28□□□□□ -1.724e-9■■■■■ 201.5
UTP3Q9NQZ2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 201.3
UTP3Q9NQZ2 QSOX2-202ENST00000455222 851 ntTSL 57.19□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 201.3
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 314.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 201.3
UTP3Q9NQZ2 IFT122-224ENST00000512157 734 ntTSL 514.08□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 200.7
UTP3Q9NQZ2 IFT122-232ENST00000515783 962 ntTSL 513.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 200.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 422.26■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 322.26■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 318.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 517.82■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 SMARCA4-218ENST00000592158 409 ntTSL 29.23□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 217.93■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-206ENST00000587416 4093 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-208ENST00000589441 803 ntTSL 513.25□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 200.6
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-201ENST00000376486 875 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.861e-10■■■■■ 200.5
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-211ENST00000641437 1911 nt17.71■□□□□ 0.431e-10■■■■■ 200.5
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