Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MEPEQ9NQ76 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms