Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CASS4Q9NQ75 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CASS4Q9NQ75 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms