Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY9Q9HBG7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms