Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLSPNQ9HAW4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms