Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1DQ9H5J8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms