Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ASXL3Q9C0F0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASXL3Q9C0F0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms