Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2OQ9C0C9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2OQ9C0C9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms