Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BCO2Q9BYV7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BCO2Q9BYV7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms