Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPCDR1Q9BY65 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms