Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC4A5Q9BY07 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC4A5Q9BY07 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms