Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BBS2Q9BXC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS2Q9BXC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms